الجفاف وقلة الأمطار تساهم في نقص في إمدادات المياه في البلاد، والحفاظ على تلك إمدادات كافية من المياه للاستخدامات الزراعية والمحلية هي واحدة من المشاكل عمان البيئية الأكثر إلحاحا، مع محدودية موارد المياه المتجددة، ويستخدم 94٪ من المياه المتوفرة في الزراعة و 2٪ للنشاط الصناعي، والغالبية من مصادر المياه الجوفية في المناطق الصحراوية ومياه الينابيع في التلال والجبال. مياه الشرب غير متوفرة في جميع أنحاء البلاد، عن طريق الأنابيب أو تسليمها.
وقد أظهرت التربة في السهول الساحلية، مثل صلالة، زيادة مستويات الملوحة، وذلك بسبب الاستغلال المفرط للمياه الجوفية والتعدي من قبل مياه البحر في المياه الجوفية. تلوث الشواطئ والمناطق الساحلية الأخرى بواسطة حركة ناقلات النفط عبر مضيق هرمز وخليج عمان هي أيضا خطر مستمر.